超聲波應用于金屬材料的焊接，雖然可以獲得良好的焊接效果。而整個系統的超聲波發生器和聲學系統與機械系統相結合。在穩定性、可操作性和可靠性方面還存在一些問題。因此，聲學系統(換能器、喇叭、連接部件)的設計，以及聲學系統與試件的連接等都是非常關鍵的問題。
對金屬超聲焊接機理認識不足。超聲波金屬焊接中是否有金屬熔化現象。它只是一種固相焊接方法，或金屬之間的“粘接”過程，需要進一步研究。
超聲波金屬焊接工藝參數的影響因素很多，不易總結。
由于焊接所需的功率隨工件厚度和硬度的增加呈指數級增加，因此大功率超聲波焊接機制造難度大，成本高。隨著焊接功率的進一步增加。在聲學系統的設計和制造中不僅會面臨一系列更加困難的問題，而且可能無法達到預期的工藝結果。因此，它目前限于薄的部件，如焊絲、箔和薄板。
超聲波焊接機的“開放性”比較差，工件的投影尺寸不能超過焊接系統的允許范圍。目前接頭的形式限于搭接。
焊點表面易發生高頻機械振動，可能對邊緣造成疲勞損傷。對硬脆材料焊接不佳。
目前超聲波焊接的焊接質量檢測比較困難。無損檢測設備尚未普及。普通方法不能用于監控。這也給批量生產造成了一定的困難。
